1990. godine pokušao je građanima SR Bosne i Hercegovine, ukazati da se obruč oko njih steže.
No, krajem 1991. godine misteriozno je nestao.
Potraga za njim trajala je oko mjesec dana. Poslije demonstracija pred općinskom zgradom u Loparama tadašnji predsjednik SDS (Kerović), kasniji četnički vojvoda, okupljenom narodu ispred općine je poručio:
– Ništa ne brinite, Abdulaha ćete dobiti živa ili mrtva.
Dvije sedmice poslije, Kovačevića su pronašli lovci na padinama Vlastaka na Majevici.
Bio je izbačen iz helikoptera koji je toga dana kružio iznad Majevice. Bio je to helikopter JNA.
Očevici opisuju da su po njegovom tijelu bili urezani krstovi, tijelo mu je bilo spaljeno vatrom, puno lomova i modrica.
Njegove ubice nikada nisi pronađene i procesuirane.
Nekoliko mjeseci nakon njegove smrti, zloglasni Željko Ražnatović Arkan i negove jedinice, u saradnji sa lokalnom policijom i vojskom ubili su i protjerali na hiljade Bošnjaka iz ovog dijela medjunarodno priznate Republike Bosne i Hercegovine.
